Michael Stoddart a commencé sa formation musicale en tant que choriste à l'abbaye de Westminster où il a étudié l'orgue avec Christopher Herrick. Après des études secondaires à la Haberdashers' Aske's School d'Elstree et l'obtention de son ARCO, il a été nommé Organ Scholar au Magdalen College d'Oxford. Ici, il a joué un rôle à part entière dans la vie musicale d'Oxford à la fois en tant qu'organiste, jouant quotidiennement des vêpres chorales, et en tant que chanteur suppléant à Christ Church et au New College. De retour à Londres, il fut nommé organiste et chef de chœur de St Peter's Streatham, où il dirigea un chœur mixte et put apprécier de jouer d'un instrument Hill à quatre claviers, et chanta en tant que commis laïc adjoint à la cathédrale Saint-Paul.

Il s'installe ensuite à Paris pour une longue période d'études d'orgue au Conservatoire de Paris avec Susan Landale. Il est nommé organiste puis chef de chœur de l'église Saint-Georges et s'implique dans la vie musicale de la cathédrale d'Evreux, où il initie une chorale d'enfants. Il a également participé aux projets d'un nouvel orgue dans la cathédrale. Il dirige ensuite le Chœur d'Enfants de l'église parisienne de St Louis en l'Ile et passe deux ans comme organiste assistant à la Cathédrale Américaine de Paris.

Returning to the UK in 2004, he was appointed Organist and Director of Music at St Mary's Portsea and Musical Director of the St Mary's Music Foundation where he greatly expanded the children's choir. He was also Assistant Sub-Organist at Portsmouth Cathedral and gained his FRCO. As a deputy lay clerk he frequently sang with the choirs of Winchester, Chichester and Portsmouth cathedrals.

Nommé organiste et directeur musical de la cathédrale de Newcastle en 2009, il était responsable de la formation des chœurs de garçons, de filles et d'adultes de la cathédrale qui chantent pendant six offices hebdomadaires réguliers, et avait la responsabilité globale de tous les aspects de la création musicale dans la cathédrale.

S'installant à Auckland, en Nouvelle-Zélande, en 2016, il a maintenu un emploi du temps chargé en jouant de l'orgue, en formant une chorale, en chantant et en enseignant. Jusqu'en mars 2021, il était organiste associé de la cathédrale Saint-Patrick, dans le centre-ville d'Auckland.

Michael et Elisabeth ont récemment déménagé à Avignon, dans le sud de la France, pour se rapprocher de leur famille dans l'hémisphère nord. Michael est désormais organiste co-titulaire à la Basilique Notre Dame des Doms, jouant à la fois de l'orgue du chœur Cavaillé-Coll/Mutin et de l'Orgue Doré Piantanida.

D'avril à août 2023, Michael a été organiste adjoint par intérim à l'abbaye de Bath au Royaume-Uni et a bénéficié d'un emploi du temps chargé, accompagnant les chœurs de garçons et de filles de l'abbaye avec les commis laïcs de l'abbaye. C'est par hasard qu'ils ont été entendus en tournée à Avignon et Malaucène en juillet 2023.

Michael est de retour à Avignon pour un programme de récital chargé en plus de ses responsabilités liturgiques à La Basilique Notre Dame des Doms ainsi que dans les églises de la ville d'Avignon.

Ses passe-temps incluent l'astronomie, le cyclisme, la course à pied et les trains miniatures, pour lesquels il a la chance d'avoir réquisitionné une grande partie du garage.

Il est marié à Elisabeth (violon, piano et chant) et ils ont quatre filles, qui jouent toutes du piano et chantent, et à elles deux jouent également 2 violons, 2 flûtes à bec, 1 flûte, 1 hautbois et un violoncelle.